El programa de desarrollo de ciencias básicas (pedeciba) comenzó en 1988 a realizar carreras de postgrado en la UdelaR. De las carreras administradas por este Programa, compete a la FC emitir los diplomas en MATEMÁTICA, FÍSICA (y ASTRONOMÍA), y CIENCIAS BIOLÓGICAS; la Facultad asegura una parte sustancial de la enseñanza de postgrado y de las investigaciones conducentes a los trabajos de Tesis, en colaboración con otras instituciones académicas de la Universidad o extrauniversitarias y, en algunos casos, del exterior del país.

La FC, por su parte, inició en 1997 la Maestría en CIENCIAS AMBIENTALES, y en 1998 la Maestría en BIOTECNOLOGÍA; ambos postgrados son administrados enteramente por los servicios docentes y administrativos de la FC.

En 2007 se inició el dictado de la Maestría en MANEJO COSTERO INTEGRADO DEL CONO SUR (MCISur), ofrecida por la FC en conjunto con otras cuatro Facultades de la UdelaR, y en cooperación con instituciones latinoamericanas y canadienses.

• Maestría en Matemática
• Doctorado en Matemática
• Maestría en Física
• Doctorado en Física
• Maestría en Ciencias Biológicas
• Doctorado en Ciencias Biológicas
• Maestría en Ciencias Ambientales
• Maestría en Biotecnología
• Maestría en Manejo Costero Integrado del Cono Sur

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