El acuerdo entre la Fundación de Coordinación de Perfeccionamiento de Personal de Nivel Superior (CAPES) del Ministerio de Educación de Brasil y la Universidad de la República tiene como objetivo estimular proyectos conjuntos de investigación e intercambio entre docentes e investigadores brasileños y uruguayos, así como la formación de posgrado entre Brasil y Uruguay en todas las áreas del conocimiento.

Actualmente se desarrollan dos modalidades: los proyectos conjuntos y las becas de posgrado en Brasil. Los proyectos conjuntos tienen como característica el fomento e intercambio de estudiantes de doctorado y perfeccionamiento de docentes e investigadores en etapas de posgrado, estímulo a cooperación y redes y coordinación conjunta de trabajos científicos.