La Maestría en Física del PEDECIBA se desarrolla conjuntamente con la Facultad de Ciencias y los objetivos son: formar personas capaces de hacer uso de sus conocimientos en Física y asesorar sobre su utilización en aplicaciones de carácter científico y tecnológico; enseñarla a nivel universitario y, eventualmente, contribuir al mejoramiento de la enseñanza de la Física en otros niveles; colaborar en proyectos de investigación en Física Básica y Aplicada, así como continuar estudios a nivel de doctorado.