La Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII) es una agencia estatal que gestiona varios programas de apoyo a proyectos de investigación así como también becas de estudios de grado y posgrado. El Fondo Clemente Estable y el Fondo María Viñas cubren investigación básica y aplicada en distintas disciplinas mientras que los fondos sectoriales financian proyectos en áreas específicas.
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Sitio web: http://www.anii.org.uy/apoyos/investigacion/