La etapa final del proceso de Evaluación Institucional consiste en la elaboración de un plan, que se constituye como un plan estratégico de desarrollo de la institución. Contiene las valoraciones efectuadas en el Informe de Autoevaluación y las recomendaciones de los Evaluadores Externos, incluyendo las acciones que se consideran pertinentes para superar o eliminar las debilidades detectadas en la evaluación. Debe abarcar objetivos específicos, indicadores de los logros, fechas, responsables de la ejecución y recursos necesarios.

El Plan de Desarrollo se elaboró durante el segundo semestre de 2023 en un proceso de elaboración y discusión colectiva. Finalmente, el 24 de junio de 2024 el Consejo de la Facultad aprobó el Plan de Desarrollo Institucional de la Facultad de Ciencias.